环境经济工作组是在CCICED第一阶段“资源核算与价格政策”工作组的基础上组建的，因此其工作是第一阶段工作的逻辑延伸。工作组在第二阶段的工作将在第一阶段发展的概念和实证方法的基础上，就环境税费政策和国民收入核算进行分析，同时对工业污染、生物多样性和可持续自然资源管理等问题进行深入的应用性案例研究，以便为中国政府制定宏观水平的环境经济政策提供建议，并促进环境经济理论与方法在可持续发展研究和环境政策中得到广泛应用。

工作组第二阶段的工作分为原理和应用两部分。原理部分的工作是由经济学家进行的，重点是研究经济政策的相关问题，主要项目包括：环境税费和国民收入核算。应用部分主要为案例研究，包括：

·污染控制本研究旨在对中国大中型城市污染控制方面的经济政策进行分析和评价，提出综合性政策改革建议。研究将以重庆市为研究对象。

·生物多样性以四川省为研究对象，为中国制定生物多样性保护政策提供适用的环境经济学的基本原则。

·可持续农业将选择中国最重要的农作物之一——水稻的生产为研究对象，分析其真实的经济成本，评价有关的价格和税收政策的有效性，探讨中国粮食基本自足政策的经济效果。研究区域选择在湖南省和湖北省。

·可持续渔业资源利用寻求如何正确解决渔业发展与资源保护的矛盾，妥善处理近期利益与长远利益的关系，探索中国近海渔业可持续发展之路。

·可持续草原利用从经济政策的角度考虑如何保护草原资源，提高业的产量与产值。

·环境会计通过理论分析与案例调查，研究企业层次上的环境会计合理结构的方法，为可持续发展的核算体系提供微观基础。

·对其他工作组提供有关方面的援助。